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图：阿里云高性能计算研发负责人何万青
8 月 5 日，在 2022 阿里云生命科学与智能计算峰会上，阿里云高性能计算研发负责人何万青公布了《生命科学行业云上解决方案及最佳实际》白皮书，同时推出高性能容器、大内存、高 IO 等三大高性能计算解决方案，满足基因测序与 AI 制药畛域中海量级数据分析、作业流程与环境各异等场景需要。
生命科学行业倒退至今，早已离不开高性能计算（High Performance Computing）的辅助，从计算机辅助药物设计、疫苗研发，到通过基因检测提供精准医疗服务、产前筛查等，高性能计算 HPC 在生命科学钻研中扮演着非常重要的角色。
随着云计算技术服务及实际的日趋成熟，越来越多的行业通过上云实现了整个产业的转型降级，正处于黄金期间的生命科学行业也不例外。然而，目前针对生命科学行业的解决方案大部分都为线下 IDC 超算集群计划，随着基因组学、生物制药技术的一直演进及计算机科学的一直倒退，传统计算机集群资源已无奈满足生命科学行业及技术演进的需要。
本次公布的《生命科学行业云上解决方案及最佳实际》白皮书指出，生命科学企业的 IT 基础设施次要面临资源规模固定、建设周期长和硬件资源运维老本高三大问题。同时生命科学行业也心愿拥抱公共云架构、应用异构计算与人工智能等新技术。
何万青示意， 云上高性能计算是目前 HPC 建设应用的最佳路径 。
在原来公共云与混合云两大解决方案的根底上，针对生命科学行业的不同需要，阿里云在该白皮书中新公布了高性能容器、大内存、高 IO 等三大高性能计算解决方案，共计五大解决方案：
- 公共云解决方案：提供一套通用的公共云架构的解决方案，满足用户疾速便捷应用云上 HPC 服务的需要，并基于业务的顶峰和低谷动静进行计算资源的弹性扩缩容，无效节俭业务老本。计划尤其实用于疾速倒退的生命科学企业。
- 混合云架构解决方案：局部企业领有线下 IDC 数据中心，但基础设施偏旧。随着业务的快速增长，心愿能够应用阿里云 E-HPC 提供的强劲新算力，同时利旧 IDC 数据中心资源。这种状况可用混合云架构对立治理云上云下资源，与公共云买通，反对弹性扩缩容。企业可按需抉择治理节点设置在云上或云下。
- HPC+AI 的高性能容器计划：实用于药物研发和业务流程简单多样的生信业务，波及利用版本泛滥、依赖环境简单，不同的工作流可能基于不同的操作系统和编译器构建。阿里云 E-HPC 高性能容器利用 eStack 可让应用多种软件栈的生信利用运行在同一个平台，便捷治理，反对多种调度器和底层资源，兼容性十分高。
- 生信行业利用大内存解决方案：阿里云与合作伙伴 Memverge 联合推出, 实用于须要进行海量数据分析的业务，如基因测序中每个细胞的表白量数据高达数十万条读取 (reads)，这种海量级的数据分析须要大内存容量。应用部署 MemVerge Memory Machine 软件的 ECS i4p 实例作为计算节点，可满足业务对性能的极致要求，同时阿里云 E-HPC 可主动纳管所有节点。
- 生信行业利用高 IO 解决方案：基因组织学钻研产生的数据增长疾速且需永恒保留，要求存储系统具备海量容量及高扩展性。另外，基因钻研应用软件品种泛滥，局部计算工作对 IO 吞吐要求很高。对此，阿里云与合作伙伴联科团体联合推出生信行业利用高 IO 解决方案。
上述解决方案能够笼罩生命科学行业的绝大多数场景与需要，领有笼罩寰球的丰盛算力，极致性能，弹性伸缩能力帮忙客户降本提效，管控可视化帮忙用户省心运维等劣势。目前，阿里云高性能计算广泛应用于工业仿真（CAD/CAE）、芯片设计（EDA）、生物医药资料、能源勘探与公共服务等多个行业。
「深势科技」利用弹性供给的老本优化策略，联合抢占式实例的价格，以 30% 的老本实现海量资源的交付。同时云上弹性高性能计算 E-HPC 主动运维的个性，升高了深势科技的运维老本，晋升了集群管理效率。
生命医学企业「圣庭医疗」通过上云优化了传统 IDC 集群的数据可靠性、运维老本及效率问题，基因比对与剖析效率晋升了 70%。阿里云高性能计算团队还通过联合 Slurm 业务工作流 dependency 与主动伸缩的联合，缩小了有效的计算资源节约，无效升高了应用老本。
在本次峰会上，天池大赛—“翻新大师杯冷冻电镜蛋白质构造建模大赛”颁奖典礼也同期举办，寰球近 2000 名参赛者一起摸索云计算与蛋白质钻研的前沿课题，大赛全程从阿里云 E-HPC 平台、英特尔第三代至强可扩大处理器 (Cooper Lake)、深度学习减速和增强型 AVX-512 指令集等软硬件联合的角度进行全程辅导和训练，推动全行业对人才培养的继续关注。
点击这里，观看本次峰会重磅嘉宾的精彩演讲视频。
白皮书下载：
《生命科学行业云上解决方案及最佳实际》白皮书