关于数据库:h2database-BTree-设计实现与查询优化思考-京东云技术团队

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h2database 是应用 Java 编写的开源数据库,兼容 ANSI-SQL89。既实现了惯例基于 BTree 的存储引擎,又反对日志构造存储引擎。性能十分丰盛(死锁检测机制、事务个性、MVCC、运维工具等),数据库学习十分好的案例。

本文实践联合实际,通过 BTree 索引的设计和实现,更好的了解数据库索引相干的知识点以及优化原理。

BTree 实现类

h2database 默认应用的 MVStore 存储引擎,如果要应用 基于 BTree 的存储引擎,须要特地指定(如下示例代码 jdbcUrl)。

以下是惯例存储引擎(BTree 构造) 相干的要害类。

  • org.h2.table.RegularTable
  • org.h2.index.PageBtreeIndex(SQL Index 本体实现)
  • org.h2.store.PageStore(存储层,对接逻辑层和文件系统)

BTree 的数据结构能够从网上查到具体的形容和解说,不做过多赘述。

须要特地阐明的是:PageStore。咱们数据查问和优化要害的缓存、磁盘读取、undo log 都是由 PageStore 实现。能够看到具体的文档和残缺的实现。

BTree add index entry 调用链

提供索引数据新增的调用链。同样的,索引的删除和查问都会波及到,不便 debug 参考。

  1. org.h2.command.dml.Insert#insertRows (Insert SQL 触发数据和索引新增)
  2. org.h2.mvstore.db.RegularTable#addRow (解决完的数据 Row, 执行新增)
  3. org.h2.index.PageBtreeIndex#add (逻辑层减少索引数据)
  4. org.h2.index.PageDataIndex#addTry (存储层减少索引数据)
  5. org.h2.index.PageDataLeaf#addRowTry (存储层新增实现)
// 示例代码
// CREATE TABLE city (id INT(10) NOT NULL AUTO_INCREMENT, code VARCHAR(40) NOT NULL, name VARCHAR(40) NOT NULL);
public static void main(String[] args) throws SQLException {
    // 留神:MV_STORE=false,MVStore is used as default storage
    Connection conn = DriverManager.getConnection("jdbc:h2:~/test;MV_STORE=false", "sa", "");
    Statement statement = conn.createStatement();
    // CREATE INDEX IDX_NAME ON city(code); 增加数据触发 BTree 索引新增
    // -- SQL 实例化为:IDX_NAME:16:org.h2.index.PageBtreeIndex
    statement.executeUpdate("INSERT INTO city(code,name) values('cch',' 长春 ')");
    statement.close();
    conn.close();}

Code Insight

联合上述的示例代码,从索引新增的流程实现来理解 BTree 索引的个性以及应用的注意事项。从底层实现剖析索引的运行,对 SQL 索引应用和优化有进一步意识。

表增加数据

 public void addRow(Session session, Row row) {
    // MVCC 管制机制,记录和比对以后事务的 id
    lastModificationId = database.getNextModificationDataId();
    if (database.isMultiVersion()) {row.setSessionId(session.getId());
    }
    int i = 0;
    try {
        // 依据设计规范,indexes 必定会有一个汇集索引(h2 称之为 scan index)。①
        for (int size = indexes.size(); i < size; i++) {Index index = indexes.get(i);
            index.add(session, row);
            checkRowCount(session, index, 1);
        }
        // 记录以后 table 的数据行数,事务回滚后会相应递加。rowCount++;
    } catch (Throwable e) {
        try {while (--i >= 0) {Index index = indexes.get(i);
                // 对应的,如果产生任何异样,会移除对应的索引数据。index.remove(session, row);
            }
        }
        throw de;
    }
}

① 同 Mysql InnoDB 数据存储一样,RegularTable 必有,且只有一个汇集索引。以主键 (或者隐含自增 id) 为 key, 存储残缺的数据。

汇集索引增加数据

  • 索引中的 key 是查问要搜寻的内容,而其值能够是以下两种状况之一:它能够是理论的行(文档,顶点),也能够是对存储在别处的行的援用。在后一种状况下,行被存储的中央被称为 堆文件(heap file),并且存储的数据没有特定的程序(依据索引相干的)。
  • 从索引到堆文件的额定跳跃对读取来说性能损失太大,因而可能心愿将被索引的行间接存储在索引中。这被称为汇集索引(clustered index)。
  • 基于主键扫描即可惟一确定、并且获取到数据,汇集索引性能比非主键索引少一次扫描
public void add(Session session, Row row) {
    // 索引 key 生成 ②
    if (mainIndexColumn != -1) {
        // 如果主键非 long, 应用 org.h2.value.Value#convertTo 尝试把主键转为 long
        row.setKey(row.getValue(mainIndexColumn).getLong());
    } else {if (row.getKey() == 0) {row.setKey((int) ++lastKey);
            retry = true;
        }
    }

    // 增加行数据到汇集索引 ③
    while (true) {
        try {addTry(session, row);
            break;
        } catch (DbException e) {if (!retry) {throw getNewDuplicateKeyException();
            }
        }
    }
}

② 对于有主键的状况,会获取以后 row 主键的值,转为 long value。对于没有指定主键的状况,从以后汇集索引属性 lastKey 自增失去惟一 key。

只有指定主键的状况,才会校验数据反复(也就是索引 key 反复,自增 lastKey 是不会有反复值的问题)。

③ 汇集索引 PageDataIndex 依照 BTree 构造查找对应的 key 地位,依照主键 /key 的程序,将 Row 存储到 page 中。非汇集索引 PageBtreeIndex 也是这样的解决流程。

这其中波及到三个问题:

  1. 如何查找 key 的地位,也就是 BTree 地位的计算?
  2. 如何计算 Row(理论数据)存储 Page 中的 offsets?
  3. Row 是怎么写入到磁盘中的,何时写入的?

索引数据存取实现

  • B 树将数据库分解成固定大小的 块(block) 或 分页(page),传统上大小为 4KB(有时会更大),并且一次只能读取或写入一个页面。
  • 每个页面都能够应用地址或地位来标识,这容许一个页面援用另一个页面 —— 相似于指针,但在硬盘而不是在内存中。(对应 h2 database PageBtreeLeaf 和 PageBtreeNode)
  • 不同于 PageDataIndex,PageBtreeIndex 依照 column.value 程序来存储。增加的过程就是比对查找 column.value,确定在块(block)中 offsets 的下标 x。剩下就是计算数据的 offset 并存入下标 x 中。
/**
 * Find an entry. 二分查找 compare 所在的地位。这个地位存储 compare 的 offset。* org.h2.index.PageBtree#find(org.h2.result.SearchRow, boolean, boolean, boolean)
 * @param compare 查找的 row, 对应上述示例 compare.value = 'cch'
 * @return the index of the found row
 */
int find(SearchRow compare, boolean bigger, boolean add, boolean compareKeys) {
    // 目前 page 持有的数据量 ④
    int l = 0, r = entryCount;
    int comp = 1;
    while (l < r) {int i = (l + r) >>> 1;
        // 依据 offsets[i],读取对应的 row 数据 ⑤
        SearchRow row = getRow(i);
        // 比大小 ⑥
        comp = index.compareRows(row, compare);
        if (comp == 0) {
            // 惟一索引校验 ⑦
            if (add && index.indexType.isUnique()) {if (!index.containsNullAndAllowMultipleNull(compare)) {throw index.getDuplicateKeyException(compare.toString());
                }
            }
        }
        if (comp > 0 || (!bigger && comp == 0)) {r = i;} else {l = i + 1;}
    }
    return l;
}

④ 每个块(page)entryCount,两个办法初始化。依据块调配和实例创立初始化,或者 PageStore 读取块文件,从 Page Data 解析失去。

⑤ 反序列化过程,从 page 文件字节码(4k 的字节数组),依据协定读取数据并实例化为 row 对象。参考:org.h2.index.PageBtreeIndex#readRow(org.h2.store.Data, int, boolean, boolean)。

⑥ 全类型反对大小比对,具体的规定参考:org.h2.index.BaseIndex#compareRows

⑦ 如果数据中存在反复的键值,则不能创立惟一索引、UNIQUE 束缚或 PRIMARY KEY 束缚。h2database 兼容多种数据库模式,MySQL NULL 非惟一,MSSQLServer NULL 惟一,仅容许呈现一次。

private int addRow(SearchRow row, boolean tryOnly) {
    // 计算数据所占字节的长度
    int rowLength = index.getRowSize(data, row, onlyPosition);
    // 块大小,默认 4k
    int pageSize = index.getPageStore().getPageSize();
    // 块文件可用的 offset 获取
    int last = entryCount == 0 ? pageSize : offsets[entryCount - 1];
    if (last - rowLength < start + OFFSET_LENGTH) {// 校验和尝试调配计算,这其中就波及到宰割页面成长 B 树的过程 ⑧}
    // undo log 让 B 树更牢靠 ⑨
    index.getPageStore().logUndo(this, data);
    if (!optimizeUpdate) {readAllRows();
    }

    int x = find(row, false, true, true);
    // 新索引数据的 offset 插入到 offsets 数组中。应用 System.arraycopy(x + 1) 来移动数据。offsets = insert(offsets, entryCount, x, offset);
    // 从新计算 offsets,写磁盘就依照 offsets 来写入数据。add(offsets, x + 1, entryCount + 1, -rowLength);
    // 追加理论数据 row
    rows = insert(rows, entryCount, x, row);
    entryCount++;
    // 标识 page.setChanged(true);
    index.getPageStore().update(this);
    return -1;
}

⑧如果你想增加一个新的键,你须要找到其范畴能蕴含新键的页面,并将其增加到该页面。如果页面中没有足够的可用空间包容新键,则将其分成两个半满页面,并更新父页面以反映新的键范畴分区

⑨为了使数据库能解决异样解体的场景,B 树实现通常会带有一个额定的硬盘数据构造:预写式日志 (WAL,即 write-ahead log,也称为  重做日志,即 redo log)。这是一个仅追加的文件,每个 B 树的批改在其能被利用到树自身的页面之前都必须先写入到该文件。当数据库在解体后复原时,这个日志将被用来使 B 树复原到统一的状态。

实际总结

  • 查问优化本质上就是拜访数据量的优化,磁盘 IO 的优化。
  • 如果数据全副缓存到内存中,实际上就是计算量的优化,CPU 应用的优化。
  • 索引是有序的,实际上就是指块文件内的 offsets 是以数组模式体现的。非凡的是 ,在 h2database 中,offsets 数组元素也是有序的(例如:[4090, 4084, 4078, 4072, 4066, 4060, 4054, 4048, 4042]),应该是 不便磁盘程序读,避免磁盘碎片化
  • 实践上,汇集索引扫描 IO 比 BTree 索引要多,因为同样的块文件内,BTree 索引 存储的数据量更大,所占的块文件更少。如果一个 table 列足够少,汇集索引扫描效率更高。

    建表须要审慎,每个列的字段长度尽可能的短,来节俭页面空间

  • 正当应用笼罩索引查问,防止回表查问。  如述示例,select id from city where code = 'cch',扫描一次 BTree 索引即可失去后果。如果 select name from city where code = 'cch', 须要扫描一次 BTree 索引失去索引 key (主键),再遍历扫描汇集索引,依据 key 失去后果。
  • 正当的应用缓存,让磁盘 IO 的影响降到最低。  比方合理配置缓存大小,冷热数据辨别查问等。

其余知识点

  • 分支因子为 500 的 4KB 页面的四层树能够存储多达 256TB 的数据)。(在 B 树的一个页面中对子页面的援用的数量称为 分支因子(branching factor)

参考

ddia/ch3.md B 树

作者:京东物流 杨攀

内容起源:京东云开发者社区

正文完
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