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参考原文：http://tecdat.cn/?p=4550
从海量数据中发现潜在标记指标, 须要借助多变量模式识别办法. 无监督的模式识别办法包含主成分剖析（PCA、聚类分析 (HCE) 等，依据模式识别模型抽提出对分类有重要奉献的指标后, 如果还须要进一步验证这些指标的差异性，那么能够在 r 语言中应用 PLSDA 模型进行剖析。
本文应用几组患者对不同指标进行评分的数据，最初应用 PLS—DA 模型挖掘出不同西医分组形式下存在差别的指标。
数据 1（少分组数据）
通过 plsda 建模之后，咱们对失去的主成分进行画图，并且对不同分组的样本进行标识。从后果中能够看到不同组别别离有哪些指标, 以及哪些指标之间存在显著的差别？
# plsda.breast <- plsda(X, Y, ncomp = 2)
# col.breast <- as.numeric(as.factor(Y))
# plotIndiv(plsda.breast, ind.names = TRUE, col = col.breast ,ellipse = TRUE)
从图中能够看到, 分组 a 和分组 b 之间存在显著的差别, 分组 cdef 之间的差别较小, 分组 a 分组 b 和分组 cdef 间均存在显著差别。
同时，为了咱们能够从数值的角度来对这些分组的差异性进行剖析。
计算他们的相关矩阵：
间隔矩阵
从批示变量矩阵的后果来看,a 的特征向量和 b 的特征向量之间存在显著差别, 而 cdef 之间的差别较小
数据 2（多分组数据）
为了测试模型的拓展性，咱们测试了更多分组数据。相似能够失去如下的成分散点图：
同样计算间隔矩阵
dd
从后果中能够看到不同组别别离有哪些指标, 以及哪些指标之间存在显著的差别？
从图中能够看到, 分组 GHEC 之间的差别较小, 分组 ABDFIJK 之间差别较小, 这两类间均存在显著差别
从批示变量矩阵的后果来看,, GHEC 特征向量之间的差别较小间隔也较小, 分组 ABDFIJK 之间差别较小间隔也较小, 这两类间均存在显著差别