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MySQL 数据库区别于其余数据库的最重要的一个特地就是其插件式的表存储引擎。MySQL 存储引擎提供了一系列规范的治理和服务反对，每个存储引擎是底层物理构造的实现。
须要留神的是，存储引擎是基于表的，而不是数据库。
InnoDB
InnoDB 存储引擎反对事务，其特点是行锁设计、反对外键、并反对相似于 Oracle 的非锁定读，即默认读取操作不会产生锁。
从 MySQL 数据库 5.5.8 开始，InnoDB 存储引擎是默认的存储引擎。
InnoDB 通过应用 多版本并发管制（MVCC）来取得高并发性，并且实现了 4 种隔离级别，默认是 REPEATABLE（可反复读）级别。同时，应用一种被称为 next-key-locking 的策略来防止幻读（phantom）景象的产生。除此之外，InnoDB 存储引擎还提供了插入缓存（insert buffer）、二次写（double write)、自适应哈希索引（adaptive hash index）、预读（read ahead）等高性能和高可用的性能。
对于表中数据的存储，InnoDB 存储引擎采纳了汇集的形式，因而每张表的存储都是按主键的程序进行寄存。如果没有显式地在表定义时指定主键，InnoDB 存储引擎会为每一行生成一个 6 字节的 ROWID，并认为作为主键。
MyISAM
MyISAM 存储引擎不反对事务、表锁设计，反对全文索引。在 MySQL 5.5.8 版本之前，MyISAM 是默认的存储引擎。
此外，MyISAM 存储引擎的另一个不同凡响的中央是它的缓冲池只缓存索引文件，而不缓冲数据文件，这点和大多数的数据库都十分不同。
MyISAM 存储引擎表由 MYD 和 MYI 组成，MYI 用来存放数据文件，MYI 用来寄存索引文件。