关于高性能计算:阿里云架构师朱波云上高性能计算加速药物研发

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简介:资源的弹性供给能力、灵便的定价模式以及高效的运维治理。
摘要:本文整顿自阿里云行业解决方案架构师朱波 (默苍),在阿里云云计算情报局的分享。本篇内容次要分为三个局部:

  1. 深势科技简介
  2. 深势科技 E -HPC 最佳实际
  3. 总结

01 深势科技简介

深势科技具备科研与产业落地能力。公司的科研队伍由物理建模、数值算法、机器学习、高性能计算,以及药物和资料计算等多个畛域形成。自研的新一代分子模仿算法在放弃量子力学精度的根底上,联合高性能计算,可能对数十亿原子规模的体系进行量子力学精度的计算模仿。

深势科技使用人工智能和分子模仿算法,联合先进计算伎俩求解重要迷信问题,为人类文明最根底的生物医药、能源、资料和信息科学与工程钻研打造新一代微尺度工业设计和仿真平台。

02 深势科技 E -HPC 最佳实际

深势科技药物设计平台是基于人工智能、物理建模和高性能计算的新一代药物设计平台。平台提供包含构造建模、靶点发现、虚构筛选、分子举荐、联合亲和力评估和大分子药物设计等临床前药物发现阶段的各类场景的残缺解决方案,提供一站式的计算服务。

深势科技的业务需要次要有三点:

第一,深势科技的业务量稳定较大,心愿可能提供基于作业负载的弹性伸缩能力,最大化利用计算资源。

第二,高性能运维治理。深势科技有大量超算集群,算力资源调度和算力资源管理是刚需,因为集群的作业量很大,深势科技心愿提供作业细力度的费用账单,便于计费。

第三,高性价比。深势科技作为初创企业,谋求高性价比,心愿以较低成本实现无效计算。

阿里云凭借当先的产品和技术支持,成为深势科技的抉择。首先,针对弹性问题,阿里云超大规模的 CPU,GPU,算力资源池和弹性供给能力,能随时响应客户的各种计算需要。

阿里云是国内少有提供云上高弹性、高性能计算平台 E -HPC 的云厂商。阿里云 E -HPC 集群的主动伸缩能力,超过传统超算的动态资源分配,用户可依据负载,实现按需扩容或缩容。

通过自定义设置,无效晋升作业吞吐量,放慢作业处理速度,极大晋升集群的利用率。

其次,针对高效运维治理问题,阿里云的主动运维和可视化治理技术,E-HPC 可为客户提供集权治理、作业管理、用户治理和可视化的能力。在不扭转科学计算业务应用习惯的同时,提供更高效的弹性集群调度服务,更好地应用算力资源。

阿里云平台实现对集群的被动运维。热降级、迁徙及自动化运维的应用性,让深势科技无需治理硬件资源的生命周期,晋升集群管理效率。让客户可能专一于利用与科研自身,更加便捷的应用云超算带来的便当。

与此同时,基于费用核心的账单,E-HPC 提供开源计费工具,反对作业细力度的费用统计,高效解决计费需要。

针对高性价比的需要,阿里云上的算力资源有灵便的定价模式,能够按需按量计费。用更灵便的购买形式,综合优化算力老本。阿里云的解决方案满足了深势科技,低成本构建高可用算力集群的需要。

通过加阿里云算力集群,均匀每条管线的合成规模由上千放大到数十,大幅度降低合成老本,缩小定制合成的等待时间。

Uni-Fold 克服了 AlphaFold2 未开源训练代码、硬件反对繁多、模型不可商用等局限性。在训练与推理环节进行了 NVIDIA GPU 上的适配、性能优化及功能完善。

Hermite Uni-FEP 可能精准预测,蛋白 - 配体联合的能力。已有蛋白 - 配体的共晶构造,在药化家教训领导下,对初始配体分子进行革新润饰,借助 FEP 准确计算革新前后的亲和力差别,代替非必要的试验,实现降本增效。

E-HPC 实现多节点并行计算,作业调度器解决计算资源的弹性治理和任务调度。

03 总结

阿里云高性能计算,为生命科学行业提供了海量的弹性计算能力、便捷的资源工作管理工具、高效的数据存储和剖析报表,无效撑持生命科学行业需要,保障业务有序高效进行。

阿里云与深势科技独特打造了老本更低、算力更优的云上生命科学计算平台,实现算力普惠,将来也将独特实现更大的幻想,让生命科学产业与云计算技术的交融更深刻。

点击这里,观看嘉宾的演讲视频回放。

正文完
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