做优化的数据库工程师请参考!CynosDB的计算层设计优化揭秘

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本文由云 + 社区发表本文作者:孙旭,腾讯数据库开发工程师,9 年数据库内核开发经验;熟悉数据库查询处理,并发控制,日志以及存储系统;熟悉 PostgreSQL(Greenplum,PGXC 等)、Teradata 等数据库内核实现机制。

CynosDB 是腾讯数据库研发团队推出的自研数据库,有 PostgreSQL 和 MySQL 两个版本。本文以兼容 PostgreSQL 版 CynosDB 为例,介绍我们的架构设计和优化思路。
1、概述
PostgreSQL 是世界上最先进的开源数据库,始于 1986 年,有 30 多年的社区演进历史。其先进的架构、可靠性以及丰富的功能已经获得业界高度认可。同时,PostgreSQL 能够在多种操作系统上运行,支持多种索引类型和扩展,特别是对 PostGIS 扩展的支持,可以让 PostgreSQL 轻松的处理地理信息数据。
兼容 PostgreSQL 版 CynosDB 作为 PostgreSQL 在 NewSQL 领域的一个产品,也具有良好的扩展性。由其架构特点带来的资源池化,可以让用户付出更少的成本而获得同等的性能,并且不损失 PostgreSQL 数据库原有的功能特性。
2、基础架构
现有共有云上的数据库存在一些不足:
1. 网络 IO 重。传统云上的主备架构下,会有大量数据需要写到磁盘,主要包括:WAL LOG、脏页数据、防止页部分写的 Double Write 或者 Full Page Write。
2. 主从实例不共享数据。一方面浪费了大量存储,另一方面进一步加重了网络 IO。这样会导致磁盘利用率低、CPU 闲置等问题。
而 CynosDB 可以通过日志下沉、共享存储来解决上述问题,以实现共有云数据库的高性价比、高可用性以及弹性扩展。其基础架构如下:

架构中的组件:
1. master 是数据库的主实例,负责接收应用的读写事务请求。
2. slave 是数据库的只读实例,负责处理应用的读请求,可以支持多个 slave 实例。
3. CynosStore Client 提供访问分布式存储(CynosStore)的接口。DB 引擎通过这些接口访问存储,完成数据文件的读写等操作。
4. CynosStore 是一个分布式存储系统,存放数据库的数据和日志,并负责日志到数据页面的转换。
4. 集群管理服务负责整个系统的管理,例如:存储扩容,实例创建等。
5. 冷备存储用来存储系统的日志。
master 实例将数据的变更以日志方式发送到存储系统(CynosStore)中,同时 CynosStore 会定期将日志合并到数据页面上。因此,CynosDB 无需将脏页写入到存储中,这点与传统数据库是不同的。slave 数据库实例没有写事务,不会向存储发送日志,但是会从存储中读取页面,也会接收 master 实例的日志来刷新内存中的数据页面;如果收到的日志所对应的页面没有在 slave 的内存中,则会丢弃这些日志。
从架构上看,CynosDB 实现了存储和计算分离,并把资源进行池化,因此适合云上部署。而且计算和存储传输数据的仅有日志流,无需写脏页面,因此也减少了系统中的网络量。总的来说,CynosDB 具有如下优势:
1. 计算能力弹性扩展。可以快速增加 slave 节点来扩展读能力,而不必进行全量的数据拷贝。
2. 存储能力弹性扩展。不像传统数据库那样受单机存储能力的限制。
3. 充分利用硬件资源。缓解传统主备架构中的 CPU 闲置、磁盘利用率不高等问题。
4. 备份容易。备份完全由后台持续进行,用户无需干预。
3、兼容 PostgreSQL 版 CynosDB 的计算层架构
CynosDB 实现了计算与存储分离,系统也因此被分成两大块:计算层和存储层。计算层负责 SQL 解析、日志生成等;存储层负责数据存储、日志归档以及日志合并等。本节以 CynosDB 的 PostgreSQL 兼容版本为例来介绍计算层架构。其计算层架构如下图所示。为了实现这种 NewSQL 架构,我们对 PostgreSQL 内核做了新设计:

灰色部分是 PostgreSQL 内核原生模块:
1. SQL:PostgreSQL 的 SQL 引擎,包括词法 / 语法分析、语义分析、查询重写 / 优化和查询执行。CynosDB 的设计不涉及 SQL 层改动,因此它兼容 PostgreSQL 原来的 SQL 语法和语义。
2. Access:数据库的访问层,定义了对象的组织方式和访问方法。其中包括:
lHeap:表实现以及访问方法,包括扫描、更新、插入、删除等。
lbtree/gin/gist/spgist/hash/brin:索引实现,包括各种索引的实现和操作方式,如索引扫描、插入等。
lCLOG/MultiXACT:与事务提交状态以及并发等。
Access 是设计和优化的重点模块。当表和索引等数据库对象被修改时,原生的 PostgreSQL 会生成 XLog,并写入到日志文件中。在 CynosDB 中,这些对象修改时也会生成日志,但是这些日志不会写本地的日志文件,而是发送到 CynosStore 中。
3. storage/buffer:buffer pool 和存储管理,调用文件接口对数据文件进行读写。在 CynosDB 中使用 CynosStore Client 对 CynosStore 中的文件进行操作。
5. CynosStore Client 提供访问 CynosStore 的接口,以完成数据库对数据文件的操作。包括数据页面读取接口、日志发送接口等。
6. 分布式存储 CynosStore 是一个基于日志的分布式的块存储,在本文中不做重点介绍。
CynosDB 的计算层把数据文件修改所生成的日志,通过 CynosStore Client 发送到分布式存储 CynosStore 中,而 CynosStore 会将日志定时合并到数据页面上。这里比较重要的一点是,计算层写出日志并不是 PostgreSQL 原生的 XLog,而是我们自己重新设计的日志系统和日志格式。因此 CynosDB 不依赖于 PostgreSQL 的原生日志系统,这种设计也可以让我们有机会在 CynosDB 上做更多的性能优化。具体可以参见下节。
4、架构优化
CynosDB 计算层的架构设计遵循了如下思路:
1.“极简 IO”。即,降低网络 / 磁盘 IO
2. 高效的系统设计。异步的日志设计、降低计算层 CPU 负载
通过这些设计,使 CynosDB 的性能比云上的同等配置性能要高。本节主要介绍计算层所做的优化手段。
4.1 日志系统
兼容 PostgreSQL 版 CynosDB 的底层存储 CynosStore 是一个支持日志写的、可以提供多版本读的、分布式的块设备,DB 引擎对存储中文件的修改,都是以日志的方式发送到存储中。其日志格式是:< 页面号,页面偏移,修改内容,修改长度 >,含义是:在页面的哪个偏移做了什么内容的修改。这样设计的日志是幂等的。
以表插入元组为例,PostgreSQL 原来的 XLog 日志格式可能是:
<relfilenode, pageno, offsetnum,informask2,infomask,hoff,tuple_data>:代表在页面(由 relfilenode 和 pageno 来确定一个页面)的 offsetnum 位置插入一条元组,插入的元组是在恢复时由 informask2, infomask, hoff, tuple_data 等信息进行重构。
同样的操作,在 CynosDB 中生成的日志可能如下。假设在页面号为 n 的页面上插入元组 tuple:
<n,10,(char *) &pd_flag,2> — 保存页面头 pd_flag 到日志
<n,12,(char *) &pd_lower,2> — 保存页面头 pd_lower 到日志
<n,14,(char *) &pd_upper,2> — 保存页面头 pd_upper 到日志
<n,36,(char *) &ItemIdData,4> — 保存 ItemIdData 数组的第 3 个元素到日志
<n,7488,(char *) tuple,172> — 保存 tuple 到日志
这些条目记录了页面在插入元组时的所有修改,它们最终会在 CynosStore Client 中形成一个 MTR(mini-transaction record:多条日志的集合,代表对数据库存储结构的一次原子修改,例如:btree 结构、页面结构的修改;在日志重放的时候需要将一个 MTR 的所有日志都应用完毕,否则会导致数据库存储结构的破坏),并放到日志流中发送到存储。当存储需要将这个 MTR 合并到页面时,要保证 MTR 中的所有日志应用完毕,任何不完全的应用都会导致页面结构不正确。
利用日志特点,我们对 PostgreSQL 的内核进行了优化,而优化之后的日志大小开销与 PostgreSQL 的原生 XLOG 差不多。这些优化和设计包括:
1. 移除原本 PostgreSQL 中 full page write(FPW)特性。为了保证系统 crash 再重启之后,那些部分写的页面(torn page)可以被正确恢复,PostgreSQL 在 Checkpoint 之后,对页面执行第一次被修改时,会将整个页面记录到日志中,这种特性就是 FPW,类似 MySQL 的 double write。当 crash recovery 时,系统会以这个全页作为基页面进行日志回放,并将恢复好的页面写到存储,而不必关心存储页面中的页面是否是半页。由于 CynosDB 日志的幂等性,当出现半页写时,系统直接重新在此页面上直接进行日志回放,即可将页面修复到一致状态。因此 CynosDB 中无需原生的 FPW,从而减少了日志量。
2. 移除系统中脏页面刷盘操作。CynosDB 通过日志保存页面的修改,并且可以通过在基页上合并日志而得到最新页面,因此无需原本系统的刷脏操作,仅仅刷日志就足够。
通过如上优化,可以很大程度上减少网络 IO 和日志量。
3. 除了以上对 PostgreSQL 内核的优化,CynosDB 对日志的记录方式也进行了精简和压缩。CynosDB 的日志都有日志头(LogHeader),如果修改同一个页面的多条日志共享一个日志头,则可以省去多个日志头的开销,如下图所示:

LH 代表 LogHeader,Log Element 代表对页面的页一次修改。如上图,有两条对 Block1 的修改日志,并且每个修改都有一个日志头(LH),经过日志头合并优化后,形成新的 MTR 中,修改 Block1 的那些日志共享了同一个日志头。
如果修改同一个页面的两条日志是相邻的,那么可以将两条日志进一步合并成一条日志。这种方式减少了日志条目,从而可以提高日志合并和页面生成速度。
4.2 页面 CRC
在 PostgreSQL 中,页面在刷盘前会计算并填充页面的 CRC 属性,而在 CynosDB 中,如果为 CRC 也生成了一条日志写入到存储中的话,会增加计算节点的 CPU 负担和日志条数。为了解决这个问题,我们将 CRC 的计算任务下放到存储中,从而减轻了计算层的 CPU 负担,以及日志条数。
4.3 异步表扩展
原生的 PostgreSQL 数据库使用的是本地文件系统存储数据,其文件扩展操作同步并实时的反映到磁盘文件上。但是 CynosDB 的扩展操作是通过日志实现,如果每次扩展都对日志做一次 flush 操作,让扩展实时的反应到存储上,势必会影响系统的性能。因此,我们实现了文件的异步扩展,即文件扩展的日志先保留在系统的日志 buffer 中,而不是每次扩展都实时的刷新到存储中,当事务提交的时候再把这些日志刷到存储上,对数据批量导入的性能提升很明显。另外,扩展操作可以一次性在文件中扩展出多个页面,减少调用扩展操作的次数。
后续
后续我们会在新硬件、多 Master 架构等领域作更多探索,为云上的数据库产品形态带来更多惊喜和亮点。
此文已由作者授权腾讯云 + 社区发布

正文完
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