Pandas 反对多种存储格局,在本文中将对不同类型存储格局下的Pandas Dataframe的读取速度、写入速度和大小的进行测试比照。
创立测试Dataframe
首先创立一个蕴含不同类型数据的测试Pandas Dataframe。
import pandas as pd import random import string import numpy as np # Config DF df_length= 10**6 start_date= '2023-01-01' all_string= list(string.ascii_letters + string.digits) string_length= 10**1 min_number= 0 max_number= 10**3 # Create Columns date_col= pd.date_range(start= start_date, periods= df_length, freq= 'H') str_col= [''.join(np.random.choice(all_string, string_length)) for i in range(df_length)] float_col= np.random.rand(df_length) int_col= np.random.randint(min_number,max_number, size = df_length) # Create DataFrame df= pd.DataFrame({'date_col' : date_col, 'str_col' : str_col, 'float_col' : float_col, 'int_col' : int_col}) df.info() df.head()
以不同的格局存储
接下来创立测试函数,以不同的格局进行读写。
import time import os def check_read_write_size(df, file_name, compression= None) : format= file_name.split('.')[-1] # Write begin= time.time() if file_name.endswith('.csv') : df.to_csv(file_name, index= False, compression= compression) elif file_name.endswith('.parquet') : df.to_parquet(file_name, compression= compression) elif file_name.endswith('.pickle') : df.to_pickle(file_name, compression= compression) elif file_name.endswith('.orc') : df.to_orc(file_name) elif file_name.endswith('.feather') : df.to_feather(file_name) elif file_name.endswith('.h5') : df.to_hdf(file_name, key= 'df') write_time= time.time() - begin # Read begin= time.time() if file_name.endswith('.csv') : pd.read_csv(file_name, compression= compression) elif file_name.endswith('.parquet') : pd.read_parquet(file_name) elif file_name.endswith('.pickle') : pd.read_pickle(file_name, compression= compression) elif file_name.endswith('.orc') : pd.read_orc(file_name) elif file_name.endswith('.h5') : pd.read_hdf(file_name) read_time= time.time() - begin # File Size file_size_mb = os.path.getsize(file_name) / (1024 * 1024) return [format, compression, read_time, write_time, file_size_mb]
而后运行该函数并将后果存储在另一个Pandas Dataframe中。
test_case= [ ['df.csv','infer'], ['df.csv','gzip'], ['df.pickle','infer'], ['df.pickle','gzip'], ['df.parquet','snappy'], ['df.parquet','gzip'], ['df.orc','default'], ['df.feather','default'], ['df.h5','default'], ] result= [] for i in test_case : result.append(check_read_write_size(df, i[0], compression= i[1])) result_df= pd.DataFrame(result, columns= ['format','compression','read_time','write_time','file_size']) result_df
测试后果
上面的图表和表格是测试的后果。
咱们对测试的后果做一个简略的剖析
CSV
- 未压缩文件的大小最大
- 压缩后的尺寸很小,但不是最小的
- CSV的读取速度和写入速度是最慢的
Pickle
- 体现得很均匀
- 但压缩写入速度是最慢的
Feather
最快的读写速度,文件的大小也是中等,十分的均匀
ORC
- 所有格局中最小的
- 读写速度十分快,简直是最快的
Parquet
总的来说,疾速并且十分小,然而并不是最快也不是最小的
总结
从后果来看,咱们应该应用ORC或Feather,而不再应用CSV ?是吗?
“这取决于你的零碎。”
如果你正在做一些独自的我的项目,那么应用最快或最小的格局必定是有意义的。
但大多数时候,咱们必须与别人单干。所以,除了速度和大小,还有更多的因素。
未压缩的CSV可能很慢,而且最大,然而当须要将数据发送到另一个零碎时,它非常容易。
ORC作为传统的大数据处理格局(来自Hive)对于速度的和大小的优化是做的最好的,Parquet比ORC更大、更慢,然而它却是在速度和大小中获得了最佳的均衡,并且反对他的生态也多,所以在须要解决大文件的时候能够优先选择Parquet。
https://avoid.overfit.cn/post/387acc48c7dd42a49f7bec90cc6d09ae
作者:Chanon Krittapholchai