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有时数据集来自多个中央,咱们须要将两个或多个数据汇合并成一个数据集。合并数据框的操作包含纵向合并、横向合并和依照某个共有变量合并。
1.纵向合并:rbind( )
要纵向合并两个数据框,能够应用 rbind( )
函数。被合并的两个数据框必须领有雷同的变量,这种合并通常用于向数据框中增加观测。例如:
data1 <- data.frame(id = 1:5, sex = c("female", "male", "male", "female", "male"), age = c(32, 46, 25, 42, 29))data1
data2 <- data.frame(id = 6:10, sex = c("male", "female", "male", "male", "female"), age = c(52, 36, 28, 34, 26))data2
rbind(data1, data2)
2. 横向合并:cbind ( )
要横向合并两个数据框,能够应用 cbind( )
函数。用于合并的两个数据框必须领有雷同的行数,而且要以雷同的顺序排列。这种合并通常用于向数据框中增加变量。例如:
data3 <- data.frame(days = c(28, 57, 15, 7, 19), outcome = c("discharge", "dead", "discharge", "transfer", "discharge"))data3cbind(data1, data3)
3. 依照某个共有变量合并:merge( )
有时咱们有多个相干的数据集,这些数据集有一个或多个共有变量,咱们想把它们依照共有变量合并成一个大的数据集。函数 merge( ) 能够实现这个性能,例如:
data4 <- data.frame(id = c(2, 1, 3, 5, 4), outcome = c("discharge", "dead", "discharge", "transfer", "discharge"))data4mydata <- merge(data1, data4, by = "id")mydata
full\_join( )
dplyr 包中的 full\_join( ) 函数也能实现上述性能下面的命令等价于:
options(warn=-1) # 清新显示library(dplyr)mydata <- full_join(data1, data4, by = "id")mydata
dplyr 包提供了多种用于合并数据框的函数,例如 bind\_rows( )、bind\_cols( )、left\_join( )、right\_join( ) 等,你能够查看这些函数的帮忙文档理解它们的用法。
4. 数据框的长宽格局的转换
根本包里的函数 reshape( )
能够对数据进行长宽格局之间的转换。
上面以 datasets 包里的数据集 Indometh 为例进行阐明。该数据集是对于药物吲哚美辛(indometacin)的药物代谢动力学数据,一共有 6 名试验对象,每名试验对象在间断的 8 小时内定时测定了血液中的药物浓度,共有 11 次的测定值。该材料是长格局,上面将其转换为宽格局。
data(Indometh)head(Indometh,12) # 这里减少一行,预览数据前 12 行,不便比照
wide <- reshape(Indometh, v.names = "conc", idvar = "Subject", timevar = "time", direction = "wide")wide
Indometh
:这是一个数据框或数据集,示意要进行重塑操作的原始数据。v.names
:这是一个字符串,示意要重塑的值变量的名称。在这种状况下,"conc"
示意原始数据中的浓度变量。idvar
:这是一个字符串或向量,示意标识变量的名称或变量列表。在这种状况下,"Subject"
示意原始数据中的主体标识变量。timevar
:这是一个字符串,示意工夫变量的名称。在这种状况下,"time"
示意原始数据中的工夫变量。direction
:这是一个字符串,示意重塑的方向。在这种状况下,"wide"
示意要将数据从长格局重塑为宽格局。
咱们还能够将宽格局数据 wide 从新转换为长格局:
long <- reshape(wide, idvar = "Subject", varying = list(2:12), v.names = "conc", direction = "long")head(long, 12)
函数 reshape( ) 功能强大,但外面的参数很多,应用起来略显不便。
tidyr
包以一种比拟简洁对立的格局实现数据长宽格局的转换,其中,函数 pivot_wider( )
用于把长格局数据转换为宽格局,而函数 pivot_longer( )
用于把宽格局数据转换为长格局。下面的后果也能够用下述命令失去:
library(tidyr)wide <- pivot_wider(as.data.frame(Indometh), names_from = time, values_from = conc)wide
留神在下面的函数 pivot\_wider( ) 中,咱们用函数 as.data.frame( ) 将数据 Indometh 转换成了数据框,这是因为其默认类型不是数据框。数据框 wide 也能从新转换为长格局:
long <- pivot_longer(wide, -Subject, names_to = "time", values_to = "conc")long
一个“整洁”的数据集(tidy data)应该满足:每一行代表一个观测,每一列代表一个变量。在对医学数据进行剖析之前,通常状况下应先把数据集转换为长格局,因为 R 中的大多数函数都反对这种格局的数据。
tidyr 包中的 gather()
和 spread()
同样能够用于长型、宽型数据类型转换,详见 Cookbook for R。