从string-db下载蛋白质相互作用的信息,在解决时发现蛋白A与B互作被记录了两次比方下边的例子(即AB、BA)
df.drop_duplicates()# Symbol1 Symbol2# Gnai3 Pdcl2# Pdcl2 Gnai3# Gm4340 Gm3376# Gm3376 Gm4340
而且drop_duplicates
不能去除反复,因为他们在不同的列,因而能够想个方法,新建一列。
字符串的比拟大小是依据字符串按位比拟,两个字符串第一位字符的ascii码谁大,字符串就大,不再比拟前面的,比方
"Gnai3">"Pdcl2"# False
对axis=1
是对每一行循环,总是把大的放在前边。
df.loc[:,"temp"]=df.apply(lambda x: f"{x[0]}-{x[1]}" if x[0]>x[1] else f"{x[1]}-{x[0]}",axis=1)# Symbol1 Symbol2 temp# Gnai3 Pdcl2 Pdcl2-Gnai3# Pdcl2 Gnai3 Pdcl2-Gnai3# Gm4340 Gm3376 Gm4340-Gm3376# Gm3376 m4340 Gm4340-Gm3376
这个时候再对temp的行去反复,就能够了
df.drop_duplicates(subset="temp")# Symbol1 Symbol2 temp# Pdcl2 Gnai3 Pdcl2-Gnai3# Gm4340 Gm3376 Gm4340-Gm3376
最初再删除temp列
df.drop_duplicates(subset="temp").drop(columns="temp")# Symbol1 Symbol2# Gnai3 Pdcl2# Gm4340 Gm3376