明天笔记的内容是R语言中绘图相干的基础知识，绘制简略的饼图、条形图。公众号：生信剖析笔记

饼图怎么画？

R语言中pie（）函数用于绘制饼状图，须要筹备向量数据、标签、调色板等信息，而后利用函数生成图片，语法格局为：

pie(x,  #数值向量，饼状图中每块面积大小labels = names(x), #字符向量，各扇区的名称edges = 200, #外边圆圈的边数，越大越平滑radius = 0.8, #饼图半径clockwise = FALSE,  #逻辑值，是否对各块按顺时针进行分隔density = NULL, #底纹密度angle = 45, #底纹斜率col = NULL,  #每个区域的色彩main = NULL,  #题目…)

接下来进行示例演示，咱们做一个简略的饼图。

#装置与加载R包install.packages("plotrix", repos = "https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/")library(plotrix)  #plotrix用于绘制3d饼图#输出变量x = c(1, 2, 4, 8)#输出标签名称ns = c("a", "b", "c", "d")#输出调色信息cols = c("#ED1C24","#22B14C","#FFC90E","#3f48CC")#绘制3D饼图pie3D(x,labels = ns,explode = 0.1, main = "first pie plot")#绘制立体饼图pie(x,labels = ns,col=cols)

而后能够在右下角plot窗口看到如下饼图：


能够应用 png()、jpeg()、bmp() 函数设置输入的文件格式为图片，如下：

#设置文件名称和参数png(filename = "first-pie.png",height = 400,width = 400)#绘制图形pie(x,labels = ns,col=cols)#敞开打印器（相当于把图片保留，只有这样能力关上这个图片，不然是0B，因为零碎默认处于始终编辑状态）dev.off()

条形图怎么画？

R语言中用 barplot() 函数来创立条形图，格局如下：

barplot(height, #条形图的高度width， #条的宽度sapace #条之间的间隙值horize #是否程度搁置xlab, #x轴标签ylab, #y轴标签main, #题目names.arg, #每个矩形条的名称col, #色彩)

接下来进行示例展现，绘制两个条形图，前者是常见的一维向量条形图，后者是二维向量制作的重叠条形图。

a <- c(1,2,3,4,3,2,1)names(a) <- c('a','b','c','d','e','f','g')png(filename = "secendplot.png")#绘制条形图barplot(a,main = "two barplot",legend=FALSE)dev.off()#工作目录下会有一个图片文件生成，关上能够查看后果。

接来下用矩阵来试试，3×3的矩阵绘制进去有两局部重叠在一起。

b <- matrix(c(1,2,3,4,2,3,1,4,1),nrow = 3,byrow = T)colnames(b) <- c('c1','c2','c3')rownames(b) <- c('r1','r2','r3')barplot(b,main = "3 barplot",legend=FALSE)#实现后在屏幕右下角plot窗口查看图片，也能够进行保留。

beside 参数

  • beside=FALSE 时，条形图的高度是矩阵的数值，矩形条是程度重叠的。
  • beside=TRUE 时，条形图的高度是矩阵的数值，矩形条是并列的。

比方，用刚刚矩阵的数据绘制时，增加一个参数beside=TRUE，失去下列后果。

barplot(b,main = "4 barplot",legend=FALSE,beside = TRUE)

补充内容：有时候装置R包呈现报错，装置失败。能够试试通过上面这种形式来装置，只须要复制代码，而后把想装置的包名称写进去就能够。
if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))  install.packages("BiocManager")BiocManager::install("这里填写须要装置的R包")
参考资料：https://www.runoob.com/r

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