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最近,咱们应用隐马尔可夫模型开发了一种解决方案,并被要求解释这个计划。
HMM用于建模数据序列,无论是从间断概率分布还是从离散概率分布得出的。它们与状态空间和高斯混合模型相干,因为它们旨在预计引起观测的状态。状态是未知或“暗藏”的,并且HMM试图预计状态,相似于无监督聚类过程。
视频:R语言中的隐马尔可夫HMM模型实例
例子
在介绍HMM背地的根本实践之前,这里有一个示例,它将帮忙您了解外围概念。有两个骰子和一罐软糖。B掷骰子,如果总数大于4,他会拿几颗软糖再掷一次。如果总数等于2,则他拿几把软糖,而后将骰子交给A。当初该轮到A掷骰子了。如果她的掷骰大于4,她会吃一些软糖,然而她不喜爱彩色的其余色彩(两极分化的认识),因而咱们心愿B会比A多。他们这样做直到罐子空了。
当初假如A和B在不同的房间里,咱们看不到谁在掷骰子。取而代之的是,咱们只晓得起初吃了多少软糖。咱们不晓得色彩,仅是从罐子中取出的软糖的最终数量。咱们怎么晓得谁掷骰子?HMM。
在此示例中,状态是掷骰子的人,A或B。察看后果是该回合中吃了多少软糖。如果该值小于4,骰子的掷骰和通过骰子的条件就是转移概率。因为咱们组成了这个示例,咱们能够精确地计算出转移概率,即1/12。没有条件说转移概率必须雷同,例如A掷骰子2时能够将骰子移交给他,例如,概率为1/36。
模仿
首先,咱们将模仿该示例。B均匀要吃12颗软糖,而A则须要4颗。
# 设置simulate <- function(N, dice.val = 6, jbns, switch.val = 4){ #模仿变量 #能够只应用一个骰子样本 #不同的机制,例如只丢1个骰子,或任何其余概率分布 b<- sample(1:dice.val, N, replace = T) + sample(1:dice.val, N, replace = T) a <- sample(1:dice.val, N, replace = T) + sample(1:dice.val, N, replace = T) bob.jbns <- rpois(N, jbns\[1\]) alice.jbns <- rpois(N, jbns\[2\]) # 状态 draws <- data.frame(state = rep(NA, N), obs = rep(NA, N), # 返回后果 return(cbind(roll = 1:N, draws))# 模仿场景draws <- simulate(N, jbns = c(12, 4), switch.val = 4)# 察看后果ggplot(draws, aes(x = roll, y = obs)) + geom_line()
如您所见,仅查看一系列计数来确定谁掷骰子是艰难的。咱们将拟合HMM。因为咱们正在解决计数数据,因而察看值是从泊松散布中得出的。
fit.hmm <- function(draws){ # HMM mod <- fit(obs ~ 1, data = draws, nstates = 2, family = poisson() # 通过预计后验来预测状态 est.states <- posterior(fit.mod) head(est.states) # 后果 hmm.post.df <- melt(est.states, measure.vars = # 输入表格 print(table(draws\[,c("state", "est.state.labels")\]))
## iteration 0 logLik: -346.2084 ## iteration 5 logLik: -274.2033 ## converged at iteration 7 with logLik: -274.2033 ## est.state.labels## state alice bob## a 49 2## b 3 46
模型迅速收敛。应用后验概率,咱们预计过程处于哪个状态,即谁领有骰子,A或B。要具体答复该问题,咱们须要更多地理解该过程。在这种状况下,咱们晓得A只喜爱黑软糖。否则,咱们只能说该过程处于状态1或2。下图显示了HMM很好地拟合了数据并预计了暗藏状态。
# 绘图输入 g0 <- (ggplot(model.output$draws, aes(x = roll, y = obs)) + geom_line() + theme(axis.ticks = element\_blank(), axis.title.y = element\_blank())) %>% ggplotGrob g1 <- (ggplot(model.output$draws, aes(x = roll, y = state, fill = state, col = state)) + g0$widths <- g1$widths return(grid.arrange(g0, g1plot.hmm.output(hmm1)
令人印象粗浅的是,该模型拟合数据和滤除噪声以预计状态的良好水平。偏心地说,能够通过疏忽工夫重量并应用EM算法来预计状态。然而,因为咱们晓得数据造成一个序列,因为察看下一次产生的概率取决于前一个即\(P(X\_t | X\_ {t-1})\),其中\(X_t \ )是软糖的数量。
思考到咱们结构的问题,这可能是一个绝对简略的案例。如果转移概率大得多怎么办?
simulate(100, jbns = c(12, 4), switch.val = 7)
## iteration 0 logLik: -354.2707 ## iteration 5 logLik: -282.4679 ## iteration 10 logLik: -282.3879 ## iteration 15 logLik: -282.3764 ## iteration 20 logLik: -282.3748 ## iteration 25 logLik: -282.3745 ## converged at iteration 30 with logLik: -282.3745 ## est.state.labels## state alice bob## alice 54 2## bob 5 39
plot(hmm2)
这有很多乐音数据,然而HMM依然做得很好。性能的进步局部归因于咱们对从罐中取出的软糖数量的抉择。散布越显著,模型就越容易拾取转移。偏心地讲,咱们能够计算中位数,并将所有低于中位数的值都归为一个状态,而将所有高于中位数的值归为另一状态,您能够从后果中看到它们做得很好。这是因为转移概率十分高,并且预计咱们会从每个状态察看到类似数量的察看后果。当转移概率不同时,咱们会看到HMM体现更好。
如果察看后果来自雷同的散布,即A和B吃了雷同数量的软糖怎么办?
hmm3 <- fit.hmm(draws)plot(hmm3)
不太好,但这是能够预期的。如果从中得出察看后果的散布之间没有差别,则可能也只有1个状态。
理论如何估算状态?
首先,状态数量及其散布形式实质上是未知的。利用对系统建模的常识,用户能够抉择正当数量的状态。在咱们的示例中,咱们晓得有两种状态使事件变得容易。可能晓得确切的状态数,但这并不常见。再次通过零碎常识来假如察看后果通常是正当的,这通常是正当的。
从这里开始,应用 Baum-Welch算法 来预计参数,这是EM算法的一种变体,它利用了观测序列和Markov属性。除了预计状态的参数外,还须要预计转移概率。Baum-Welch算法首先对数据进行正向传递,而后进行反向传递。而后更新状态转移概率。而后反复此过程,直到收敛为止。
在事实世界
在事实世界中,HMM通常用于
- 股票市场预测,无论市场处于牛市还是熊市
- 预计NLP中的词性
- 生物测序
- 序列分类
仅举几例。只有有察看序列,就能够应用HMM,这对于离散状况也实用。
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