简介

如果数据中有很多NaN的值,存储起来就会节约空间。为了解决这个问题,Pandas引入了一种叫做Sparse data的构造,来无效的存储这些NaN的值。

Spare data的例子

咱们创立一个数组,而后将其大部分数据设置为NaN,接着应用这个数组来创立SparseArray:

In [1]: arr = np.random.randn(10)In [2]: arr[2:-2] = np.nanIn [3]: ts = pd.Series(pd.arrays.SparseArray(arr))In [4]: tsOut[4]: 0    0.4691121   -0.2828632         NaN3         NaN4         NaN5         NaN6         NaN7         NaN8   -0.8618499   -2.104569dtype: Sparse[float64, nan]

这里的dtype类型是Sparse[float64, nan],它的意思是数组中的nan实际上并没有存储,只有非nan的数据才被存储,并且这些数据的类型是float64.

SparseArray

arrays.SparseArray 是一个 ExtensionArray ,用来存储稠密的数组类型。

In [13]: arr = np.random.randn(10)In [14]: arr[2:5] = np.nanIn [15]: arr[7:8] = np.nanIn [16]: sparr = pd.arrays.SparseArray(arr)In [17]: sparrOut[17]: [-1.9556635297215477, -1.6588664275960427, nan, nan, nan, 1.1589328886422277, 0.14529711373305043, nan, 0.6060271905134522, 1.3342113401317768]Fill: nanIntIndexIndices: array([0, 1, 5, 6, 8, 9], dtype=int32)

应用 numpy.asarray() 能够将其转换为一般的数组:

In [18]: np.asarray(sparr)Out[18]: array([-1.9557, -1.6589,     nan,     nan,     nan,  1.1589,  0.1453,           nan,  0.606 ,  1.3342])

SparseDtype

SparseDtype 示意的是Spare类型。它蕴含两种信息,第一种是非NaN值的数据类型,第二种是填充时候的常量值,比方nan:

In [19]: sparr.dtypeOut[19]: Sparse[float64, nan]

能够像上面这样结构一个SparseDtype:

In [20]: pd.SparseDtype(np.dtype('datetime64[ns]'))Out[20]: Sparse[datetime64[ns], NaT]

能够指定填充的值:

In [21]: pd.SparseDtype(np.dtype('datetime64[ns]'),   ....:                fill_value=pd.Timestamp('2017-01-01'))   ....: Out[21]: Sparse[datetime64[ns], Timestamp('2017-01-01 00:00:00')]

Sparse的属性

能够通过 .sparse 来拜访sparse:

In [23]: s = pd.Series([0, 0, 1, 2], dtype="Sparse[int]")In [24]: s.sparse.densityOut[24]: 0.5In [25]: s.sparse.fill_valueOut[25]: 0

Sparse的计算

np的计算函数能够间接用在SparseArray中,并且会返回一个SparseArray。

In [26]: arr = pd.arrays.SparseArray([1., np.nan, np.nan, -2., np.nan])In [27]: np.abs(arr)Out[27]: [1.0, nan, nan, 2.0, nan]Fill: nanIntIndexIndices: array([0, 3], dtype=int32)

SparseSeries 和 SparseDataFrame

SparseSeries 和 SparseDataFrame在1.0.0 的版本时候被删除了。取代他们的是性能更强的SparseArray。

看下两者的应用上的区别:

# Previous way>>> pd.SparseDataFrame({"A": [0, 1]})
# New wayIn [31]: pd.DataFrame({"A": pd.arrays.SparseArray([0, 1])})Out[31]:    A0  01  1

如果是SciPy 中的sparse 矩阵,那么能够应用 DataFrame.sparse.from_spmatrix() :

# Previous way>>> from scipy import sparse>>> mat = sparse.eye(3)>>> df = pd.SparseDataFrame(mat, columns=['A', 'B', 'C'])
# New wayIn [32]: from scipy import sparseIn [33]: mat = sparse.eye(3)In [34]: df = pd.DataFrame.sparse.from_spmatrix(mat, columns=['A', 'B', 'C'])In [35]: df.dtypesOut[35]: A    Sparse[float64, 0]B    Sparse[float64, 0]C    Sparse[float64, 0]dtype: object

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