最近看到在网上传的一张SIR传染病模型的图,很多人应该对这个模型不是很理解,明天就讲一下这个模型。这一篇只讲学术,不探讨别的。

SIR模型是传染病模型中最经典的一个,相似的还有SI和SIS两种。SIR是三个单词首字母的缩写,其中S是Susceptible的缩写,示意易感者;I是Infective的缩写,示意感染者;R是Removal的缩写,示意移除者。这个模型自身是在钻研这三者的关系。在病毒最开始的时候,所有人都是易感者,也就是所有人都有可能中病毒;当一部分人在接触到病毒当前中病毒了,变成了感染者;感染者会承受各种医治,最初变成了移除者。这三者的关系如下图所示:

在病毒最开始的时候S=N,而后S以每天的速度变到I,I又以每天的速度变到R,不同时刻t下这三者的关系为:

N(t) = S(t) + I(t) + R(t)S(t+1) = S(t) - S(t)I(t+1) = I(t) - I(t)R(t+1) =  R(t) + I(t)

如果咱们想要获取某个工夫t对应的S、I、R人数,须要晓得和值,以及S0和I0值。这个模型能够利用Python实现,具体代码如下:

%matplotlib inlineimport scipy.integrate as spiimport numpy as npimport pylab as plalpha=1.4247beta=0.14286TS=1.0 #察看距离ND=70.0 #察看完结日期S0=1-1e-6 #初始易感人数I0=1e-6 #初始感化人数INPUT = (S0, I0, 0.0)def diff_eqs(INP,t):    '''The main set of equations'''    Y=np.zeros((3))    V = INP    Y[0] = - alpha * V[0] * V[1]    Y[1] = alpha * V[0] * V[1] - beta * V[1]    Y[2] = beta * V[1]    return Yt_start = 0.0t_end = NDt_inc = TSt_range = np.arange(t_start, t_end+t_inc, t_inc) #生成日期范畴RES = spi.odeint(diff_eqs,INPUT,t_range)pl.subplot(111)pl.plot(RES[:,0], '-g', label='Susceptible')pl.plot(RES[:,1], '-r', label='Infective')pl.plot(RES[:,2], '-k', label='Removal')pl.legend(loc=0)pl.title('SIR_Model')pl.xlabel('Time')pl.ylabel('Numbers')pl.xlabel('Time')

最初运行下面的代码能够失去如下后果图,下面这张图示意了随着工夫t的变动S、I、R人数的一个变化趋势。

这个模型有两个假如条件:

1.一段时间内总人数N是不变的,也就是不思考新生以及天然死亡的人数
2.从S到I的变动速度、从I到R的变动速度也是放弃不变的

在理论环境中下面的两个假如个别是不太容易满足的,所以得进去的后果会和理论数据有偏差。