所有 DNA 都由一系列缩写为 A,C,G 和 T 的核苷酸组成,例如:“ACGAATTCCG”。在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。
编写一个函数来查找 DNA 分子中所有出现超过一次的 10 个字母长的序列(子串)。
示例:
输入:s = “AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT”
输出:[“AAAAACCCCC”, “CCCCCAAAAA”]
来源:力扣(LeetCode)
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我这里用的是 list,其实用 set 性能更好,list 进行查询是 O(logn),而 set 是 O(1) 的。
public List<String> findRepeatedDnaSequences(String s) {int len = s.length();
List<String> res = new ArrayList<String>();
if (len <= 10) return res;
Map<String, Integer> all = new HashMap<String, Integer>();
for (int i = 0; i <= len - 10; i++) {String str = s.substring(i, i+10);
if (all.containsKey(str)) {all.put(str, all.get(str) + 1);
} else {all.put(str,1);
}
}
for (Map.Entry<String, Integer> stringIntegerEntry : all.entrySet()) {if (stringIntegerEntry.getValue() > 1) {res.add(stringIntegerEntry.getKey());
}
}
return res;
}