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关于数据挖掘:拓端tecdatR语言复杂网络分析聚类社区检测和可视化

全文链接:http://tecdat.cn/?p=18770 

原文出处:拓端数据部落公众号

【视频】KMEANS 均值聚类和档次聚类:R 语言剖析生存幸福品质系数可视化实例

KMEANS 均值聚类和档次聚类:R 语言剖析生存幸福品质系数可视化实例

,时长 06:05

为了用 R 来解决网络数据,咱们应用婚礼数据集。

> nflo=network(flo,directed=FALSE)

> plot(nflo, displaylabels = TRUE,

+ boxed.labels =

+ FALSE)

下一步是 igraph。因为咱们有邻接矩阵,因而能够应用它

graph\_from\_adjacency_matrix(flo,

+ mode = "undirected")

咱们能够在两个特定节点之间取得最短门路。咱们给节点赋予适当的色彩

 all\_shortest\_paths(iflo,)

 

 

> plot(iflo)

咱们还能够可视化边,须要从输入中提取边缘

> lins=c(paste(as.character(L)\[1:4\],

+ "--" 

+ as.character(L)\[2:5\]  sep="" ,

+ paste(as.character(L) 2:5\],

+ "--",

 

> E(ifl)$color=c("grey","black")\[1+EU\]

> plot(iflo)

也能够应用 D3js 可视化

> library(networkD3)

> simpleNetwork (df)

下一个问题是向网络增加一个顶点。最简略的办法是通过邻接矩阵实现概率

> flo2\["f","v"\]=1

> flo2\["v","f"\]=1

而后,咱们进行集中度测量。

目标是理解它们之间的关系。

 betweenness(ilo)

 

> cor(base)

betw close deg eig

betw 1.0000000 0.5763487 0.8333763 0.6737162

close 0.5763487 1.0000000 0.7572778 0.7989789

deg 0.8333763 0.7572778 1.0000000 0.9404647

eig 0.6737162 0.7989789 0.9404647 1.0000000

能够应用档次聚类图来可视化集中度度量

hclust(dist( ase  ,

+ method="ward")

查看集中度度量的值,查看排名

 > for(i in 1:4) rbase\[,i\]=rank(base\[,i\])

在此,特征向量测度十分靠近顶点的度数。

最初,寻找聚类(以防这些家庭之间暴发和平)

> kc <- fastgreedy.community (iflo)

在这里,咱们有 3 类


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