关于数据挖掘:R语言分析蛋白质组学数据飞行时间质谱MALDITOF法峰值检测多光谱比较

•钻研生物体产生的全副蛋白质。

• Foci：鉴定、构造测定、生物标志物、通路、表白。

只有绝对较少的开源软件解决方案可用，而 R 平台则很少。

• 解决技术和生物复制的必要性。

• 绝对强度的定量令人不称心

• 钻研光谱校准对临床预后的影响。

• 模块化且易于定制的分析程序

血清肽多姆剖析显示血小板因子 4 是与胰腺癌相干的潜在甄别肽

G.M. Fiedler，A.B. Leichtle，J. Kase et al Clin Cancer Res June 1，2009 15：3812-3819

“两个显著峰（m/z 3884;5959）对辨别患者和衰弱对照的敏感性为 86.3%，特异性为 97.6%。”

“基于 MALDI-TOOF MS 的血清肽球剖析容许发现和验证血小板因子 4 [m / z 3884，7767;S.G.]作为胰腺癌的新甄别标志物。

> spectra[[1]]

> abline(v=3884, col="blue")

> plot(spectra[[1]]

> spea <- lapply(sptra, transfensty, fun=moAvg)

> plot(spea[[1]]
> lines(b, col="red");

> bl <- estiline(specta[[1]]

> speca <- lapply(spe, remoeline)
> lines(specra[[1]])

> peas[[1]]

> top <- intnsity(p) %in% sort(int
> labePeak

> peaks <- lapply(spetra, detecPeaks)

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