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关于数据挖掘:MATLAB基于深度学习Unet神经网络模型的能谱CT的基物质分解技术研究

全文链接:http://tecdat.cn/?p=31303

原文出处:拓端数据部落公众号

分析师:Jingsong Liu

CT 技术随同着肯定剂量的辐射,会对患者的身体健康造成影响,而且 高剂量的辐射会侵害人体的遗传物质,甚至造成不可逆的伤害,进而诱发癌症。因而,如何在保障成像品质的前提下尽可能地升高 CT 辐射剂量始终是科学家们 钻研的热点指标之一。此外,传统的 CT 扫描技术只能显示患者体内病灶的状态,无奈显示指标构造的化学成分信息。因为不同化学组分的生物组织通过 X 射线扫描后可能会具备相近甚至雷同的衰减系数,从而导致成像不精确进而造成误诊。

解决方案

本文利用杜克大学所提供的 XCAT 软件,构建人体模型,而后应用 MATLAB 仿真出所构建模型基于能谱 CT 的投影域物质合成数据,再利用深度学习技术对 所失去的 CT 成像数据进行学习,构建能够辨认人体骨骼和软组织的 CT 图像合成模型。所失去的模型能够在较低辐射剂量的条件下,利用能谱 CT 和深度学习 技术的原理,失去更加精确的 CT 重建图像。相较于传统 CT,能够实现在更低 的辐射剂量下失去更多更精确的人体外部组织构造信息的目标。这种最新的 CT 成像技术,将为医生提供患者更加精确的组织、病例信息,为医生做出精确高效 的诊断提供弱小的信息根底。与此同时,也极大地升高了患者所接受的医源辐射剂量,保障了患者在承受诊疗的过程中不再受到二次挫伤,为患者的衰弱提供了 重要保障。

数据源筹备

对于数据最深层的需要来自 U-net 网络模型的训练。本我的项目的试验因为试验条件受限,应用的是集体 PC 机,运算能力较小,故选取较小的训练集和测试集。本我的项目初步选取 30 张 CT 图片作为 U-net 网络的训练集,每一张图片均由 MATLAB 所仿真的能谱 CT 模型失去。每一张图片须要由 1 -140keV 下的 140 个 XCAT 人体模型拟合失去(因而,本我的项目共须要构建 4200 个不同的 XCAT 人体模型。这 4200 个模型,分属 30 个不同的部位,每一个部位都别离由 1-140keV 的 X 射线模仿照耀失去 140 个不同的模型。

特色转换

基于本章中所介绍的能谱 CT 重建实践,本我的项目选用人体组织中的骨骼和软组 织作为物质合成的两种基物质,利用 MATLAB 实现其具体算法。依据本章中对于基物质合成模型实践的具体介绍和各个公式,联合试验所得人体骨骼和软组织 的线性衰减系数,只需很短的代码就能够实现物质合成模型的仿真。本节试验目标是为 U-net 物质合成模型提供训练集和测试集。具体为利用 MATLAB 仿真出 基物质合成模型,将原始的能谱 CT 成像后果合成为骨骼和软组织,作为对应影 像的标签。利用所失去的高、低能谱成像数据作为输出。

划分训练集和测试集

建模

U-net 网络结构是全卷积神经网络(FCN)的一种,是一种广泛应用于医学 图像宰割畛域的深度学习网络,它是由弗莱堡大学 Olaf 在细胞影像学宰割较量 中提出的。因为该网络结构酷似英文字母“U”,故被称为 U-net。该网络由编 码层和解码层两局部组成。其中编码层次要作用是提取图片的上下文信息,解码层则对图片中的指标区域进行定位。U-net 网络采取数据加强策略能够实现对于样本较少的数据的精确学习。U-net 网络结构中没有全连贯层,因而能够大幅度 地缩小所须要的学习的参数量,极大地提高了网络结构的学习效率。

试验一采纳高、低能谱图像作为输出数据,以软组织宰割图像作为标签,训练 U-net 网络。网络训练后果如下

测试后果为:

由上述试验后果可知,两个试验随着训练次数的减少,它们所失去网络的准确率都逐步回升至靠近 1 的值并趋于稳定,而损失函数的值也逐步减小并趋于稳定。这阐明这两个试验训练所失去的模型最终都收敛,因此这两个基物质宰割网络是稳固无效的。

对于作者

在此对 Jingsong Liu 对本文所作的奉献示意诚挚感激,他在上海财经大学实现了金融信息工程硕士学位,善于机器学习、数理金融、数据分析。


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