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关于深度学习:PyTorch的Dataset-和TorchData-API的比较

深度神经网络须要很长时间来训练。训练速度受模型的复杂性、批大小、GPU、训练数据集的大小等因素的影响。

在 PyTorch 中,torch.utils.data.Dataset 和 torch.utils.data.DataLoader 通常用于加载数据集和生成批处理。然而从版本 1.11 开始,PyTorch 引入了 TorchData 库,它实现了一种不同的加载数据集的办法。

在本文中,咱们将比拟数据集比拟大的状况下这两两种办法是如何工作的。咱们以 CelebA 和 DigiFace1M 的面部图像为例。表 1 显示了它们的比拟特色。咱们训练应用 ResNet-50 模型。而后进行 1 轮的训练来进行应用办法和工夫的比拟。

数据集的信息如下:

CelebA (align) 图片数:202,599 总大小:1.4 图片大小:178×218

DigiFace1M 图片数:720,000 总大小:14.6 图片大小:112×112

咱们应用的环境如下:

CPU: Intel(R) Core(TM) i9-9900K CPU @ 3.60GHz(16 核)

GPU: GeForce RTX 2080 Ti 11Gb

驱动版本 515.65.01 / CUDA 11.7 / CUDNN 8.4.0.27

Docker 20.10.21

Pytorch 1.12.1

TrochData 0.4.1

训练的代码如下:

 def train(data_loader: torch.utils.data.DataLoader, cfg: Config):
     # create model
     model = resnet50(num_classes=cfg.n_celeba_classes + cfg.n_digiface1m_classes, pretrained=True)
     torch.cuda.set_device(cfg.gpu)
     model = model.cuda(cfg.gpu)
     model.train()
 
     # define loss function (criterion) and optimizer
     criterion = torch.nn.CrossEntropyLoss().cuda(cfg.gpu)
     optimizer = torch.optim.SGD(model.parameters(), lr=0.1,
                                 momentum=0.9,
                                 weight_decay=1e-4)
 
     start_time = time.time()
     for _ in range(cfg.epochs):
         scaler = torch.cuda.amp.GradScaler(enabled=cfg.use_amp)
         for batch_idx, (images, target) in enumerate(data_loader):
             images = images.cuda(cfg.gpu, non_blocking=True)
             target = target.cuda(cfg.gpu, non_blocking=True)
 
             # compute output
             with torch.cuda.amp.autocast(enabled=cfg.use_amp):
                 output = model(images)
                 loss = criterion(output, target)
 
             # compute gradient
             scaler.scale(loss).backward()
 
             # do SGD step
             scaler.step(optimizer)
             scaler.update()
             optimizer.zero_grad()
 
             print(batch_idx, loss.item())
     print(f'{time.time() - start_time} sec')

Dataset

首先看看 Dataset, 这是自从 Pytorch 公布以来始终应用的形式,咱们对这个应该十分相熟。PyTorch 反对两种类型的数据集:map-style Datasets 和 iterable-style Datasets。Map-style Dataset 在事后晓得元素个数的状况下应用起来很不便。该类实现了__getitem__()和__len__()办法。如果通过索引读取太费时间或者无奈取得,那么能够应用 iterable-style,须要实现__iter__() 办法。在咱们的例子中,map-style 曾经能够了,因为对于 CelebA 和 DigiFace1M 数据集,咱们晓得其中的图像总数。

上面咱们创立 CelebADataset 类。对于 CelebA,类标签位于 identity_CelebA.txt 文件中。CelebA 和 DigiFace1M 中的面部图像在裁剪方面有所不同,因而为了在图像上传后缩小 getitem 办法中的这些差别,必须从各个方面略微裁剪它们。

 from PIL import Image
 from torch.utils.data import Dataset
 
 class CelebADataset(torch.utils.data.Dataset):
     def __init__(self, data_path: str, transform) -> None:
         self.data_path = data_path
         self.transform = transform
         self.image_names, self.labels = self.load_labels(f'{data_path}/identity_CelebA.txt')
 
     def __len__(self) -> int:
         return len(self.image_names)
 
     def  __getitem__(self, idx: int) -> Tuple[torch.Tensor, int]:
         image_path = f'{self.data_path}/img_align_celeba/{self.image_names[idx]}'
         image = Image.open(image_path)
         left, right, top, bottom = 25, 153, 45, 173
         image = image.crop((left, top, right, bottom))
         if self.transform is not None:
             image = self.transform(image)
         label = self.labels[idx]
         return image, label
 
     @staticmethod
     def load_labels(labels_path: str) -> Tuple[list, list]:
         image_names, labels = [], []
         with open(labels_path, 'r', encoding='utf-8') as labels_file:
             lines = labels_file.readlines()
             for line in lines:
                 file_name, class_id = line.split(' ')
                 image_names.append(file_name)
                 labels.append(int(class_id[:-1]))
         return image_names, labels

对于 DigiFace1M 数据集,同一类的所有图像都在一个独自的文件夹中。然而这两个数据集中,类的标签是雷同的,所以对于在 DigiFace1M 咱们不须要获取类别,而是在 CelebA 中按类减少。所以咱们须要 add_to_class 变量。另外就是 DigiFace1M 中的图像以“RGBA”格局存储,因而仍需将其转换为“RGB”。

 class DigiFace1M(torch.utils.data.Dataset):
     def __init__(self, data_path: str, transform, add_to_class: int = 0) -> None:
         self.data_path = data_path
         self.transform = transform
         self.image_paths, self.labels = self.load_labels(data_path, add_to_class)
 
     def __len__(self):
         return len(self.image_paths)
 
     def __getitem__(self, idx: int) -> Tuple[torch.Tensor, int]:
         image = Image.open(self.image_paths[idx]).convert('RGB')
         if self.transform is not None:
             image = self.transform(image)
         label = self.labels[idx]
         return image, label
 
     @staticmethod
     def load_labels(data_path: str, add_to_class: int) -> Tuple[list, list]:
         image_paths, labels = [], []
         for root, _, files in os.walk(data_path):
             for file_name in files:
                 if file_name.endswith('.png'):
                     image_paths.append(f'{root}/{file_name}')
                     labels.append(int(os.path.basename(root)) + add_to_class)
         return image_paths, labels

当初咱们能够应用 torch.utils.data 将两个数据汇合并为一个数据集 ConcatDataset,创立 DataLoader,开始训练。

 def main():
     cfg = Config()
     celeba_dataset = CelebADataset(f'{cfg.data_path}/CelebA', cfg.transform)
     digiface_dataset = DigiFace1M(f'{cfg.data_path}/DigiFace1M', cfg.transform, cfg.n_celeba_classes)
     dataset = torch.utils.data.ConcatDataset([celeba_dataset, digiface_dataset])
 
     loader = torch.utils.data.DataLoader(
         dataset=dataset,
         batch_size=cfg.batch_size,
         shuffle=True,
         drop_last=True,
         num_workers=cfg.n_workers)
 
     utils.train(loader, cfg)

TorchData API

与 Dataset 一样,TorchData 反对 map-style 和 iterable-style 的数据处理管道。然而官网倡议应用 IterDataPipe,只在必要时将其转换为 MapDataPipe。

因为 TorchData 提供了优化的数据加载实用程序,能够帮忙咱们不便的构建解决流程。以下是一些次要的性能:

  • IterableWrapper:包装可迭代对象以创立 IterDataPipe。
  • FileListerr:给定目录的门路,将生成根目录内文件的文件路径名(path + filename)
  • Filterr:依据输出 filter_fn(函数名:filter)从源数据口过滤元素
  • Mapperr:对源 DataPipe 中的每个项利用函数(函数名:map)
  • Concaterr:连贯多个可迭代数据管道(函数名:concat)
  • Shufflerr:打乱输出 DataPipe 数据的程序(函数名:shuffle)
  • ShardingFilterr:容许对 DataPipe 进行分片(函数名:sharding_filter)

应用 TorchData 构建 CelebA 和 DigiFace1M 的数据处理管道,咱们须要执行以下步骤:

对于 CelebA 数据集:创立一个列表(file_name, label,‘ CelebA ‘),并应用 IterableWrapper 从它创立一个 IterDataPipe

对于 DigiFace1M:应用 FileLister 创立一个 IterDataPipe,返回所有图像文件的门路,应用 Mapper 来应用 collate_ann。这个函数以图像门路作为输出,并返回元组(file_name, label,‘ DigiFace1M ‘)。

下面两个步骤之后,咱们失去两个数据类型 (file_name, label, data_name) 的后果。而后应用 Concater 将它们连贯到一个数据管道中。

应用 Shufflerr,打乱程序,这与在 DataLoader 中设置了 shuffle=True 是一样的。

应用 ShardingFilter 将数据管道宰割成片。每个 worker 将领有原始 DataPipe 元素的 n 个局部,其中 n 等于 worker 的数量。(多线程解决,DataLoader 中的 num_worker)

最初就是从磁盘读取图像

残缺代码如下:

 @torchdata.datapipes.functional_datapipe("load_image")
 class ImageLoader(torchdata.datapipes.iter.IterDataPipe):
     def __init__(self, source_datapipe, **kwargs) -> None:
         self.source_datapipe = source_datapipe
         self.transform = kwargs['transform']
 
     def __iter__(self) -> Tuple[torch.Tensor, int]:
         for file_name, label, data_name in self.source_datapipe:
             image = Image.open(file_name)
             if data_name == 'DigiFace1M':
                 image = image.convert('RGB')
             elif data_name == 'CelebA':
                 left, right, top, bottom = 25, 153, 45, 173
                 image = image.crop((left, top, right, bottom))
             if self.transform is not None:
                 image = self.transform(image)
             yield image, label
 
 
 def collate_ann(file_path):
     label = int(os.path.basename(os.path.dirname(file_path))) + N_CELEBA_CLASSES
     data_name = os.path.basename(os.path.dirname(os.path.dirname(file_path)))
     return file_path, label, data_name
 
 
 def load_celeba_labels(labels_path: str) -> Dict[str, int]:
     labels = []
     data_path = os.path.split(labels_path)[0]
     with open(labels_path, 'r', encoding='utf-8') as labels_file:
         lines = labels_file.readlines()
         for line in lines:
             file_name, class_id = line.split(' ')
             class_id = int(class_id[:-1])
             labels.append((f'{data_path}/img_align_celeba/{file_name}', class_id, 'CelebA'))
     return labels
 
 
 def build_datapipes(cfg: Config) -> torchdata.datapipes.iter.IterDataPipe:
     celeba_dp = torchdata.datapipes.iter.IterableWrapper(
         load_celeba_labels(labels_path=f'{cfg.data_path}/CelebA/identity_CelebA.txt'))
 
     digiface_dp = torchdata.datapipes.iter.FileLister(f'{cfg.data_path}/DigiFace1M', masks='*.png', recursive=True)
     digiface_dp = digiface_dp.map(collate_ann)
 
     datapipe = celeba_dp.concat(digiface_dp)
     datapipe = datapipe.shuffle(buffer_size=100000)
     datapipe = datapipe.sharding_filter()
     datapipe = datapipe.load_image(transform=cfg.transform)
     return datapipe

Torch 的 DataLoader 是同时反对 Datasets 和 DataPipe 的,所以咱们能够间接应用

 def main():
     cfg = Config()
     datapipe = build_datapipes(cfg)
     loader = torch.utils.data.DataLoader(
         dataset=datapipe,
         batch_size=cfg.batch_size,
         shuffle=True,
         drop_last=True,
         num_workers=cfg.n_workers)
 
     utils.train(loader, cfg)

减速数据读取的一个小技巧

批处理中耗时最长的操作之一是从磁盘读取图片。为了缩小这个操作所破费的工夫,能够加载所有图像并将它们宰割成小的数据集,例如 10,000 张图像保留为.pickle 文件。在读取时每一个 worker 只有读取一个相应的 pickle 文件即可

 def prepare_data():
     cfg = Config()
     cfg.transform = None
     os.makedirs(cfg.prepared_data_path, exist_ok=True)
     celeba_dataset = dataset_example.CelebADataset(f'{cfg.data_path}/CelebA', cfg.transform)
     digiface_dataset = dataset_example.DigiFace1M(f'{cfg.data_path}/DigiFace1M', cfg.transform, cfg.n_celeba_classes)
     dataset = torch.utils.data.ConcatDataset([celeba_dataset, digiface_dataset])
 
     shard_size = 10000
     next_shard = 0
     data = []
     shuffled_idxs = np.arange(len(dataset))
     np.random.shuffle(shuffled_idxs)
     for idx in tqdm(shuffled_idxs):
         data.append(dataset[idx])
         if len(data) == shard_size:
             with open(f'{cfg.prepared_data_path}/{next_shard}_shard.pickle', 'wb') as _file:
                 pickle.dump(data, _file)
             next_shard += 1
             data = []
     with open(f'{cfg.prepared_data_path}/{next_shard}_shard.pickle', 'wb') as _file:
         pickle.dump(data, _file)

上面就是应用 FileLister 收集.pickle 数据集的所有门路,按 worker 划分并在每个 worker 上加载.pickle 数据。

 @torchdata.datapipes.functional_datapipe("load_pickle_data")
 class PickleDataLoader(torchdata.datapipes.iter.IterDataPipe):
     def __init__(self, source_datapipe, **kwargs) -> None:
         self.source_datapipe = source_datapipe
         self.transform = kwargs['transform']
 
     def __iter__(self) -> Tuple[torch.Tensor, int]:
         for file_name in self.source_datapipe:
             with open(file_name, 'rb') as _file:
                 pickle_data = pickle.load(_file)
                 for image, label in pickle_data:
                     image = self.transform(image)
                     yield image, label
 
 
 def build_datapipes(cfg: Config) -> torchdata.datapipes.iter.IterDataPipe:
     datapipe = torchdata.datapipes.iter.FileLister(cfg.prepared_data_path, masks='*.pickle')
     datapipe = datapipe.shuffle()
     datapipe = datapipe.sharding_filter()
     datapipe = datapipe.load_pickle_data(transform=cfg.transform)
     return datapipe

数据加载比照

咱们比拟三种不同数据加载办法。对于所有测试,batch_size = 600。
n workersDatasets, secDataPipes, secDataPipe + pickle, sec10 3581 7986 7585 10034 2993 760
当在未筹备好的数据上应用 DataPipe 进行训练时(不应用 pickle),前几百个批次生成十分快,GPU 使用率简直是 100%,但随后速度逐步降落,这种办法甚至比应用 n_workers=10 的数据集还要慢。尽管我了解这两种办法的速度是一样的因为执行的操作是一样的,但实际上却不一样

DataLoader 的最佳 n_workers 没有一个固定值,因为这取决于工作 (图像大小,图像预处理的复杂性等等) 和计算机配置(HDD vs SSD)。

当在有大量小图像的数据集上训练时,做数据的筹备是必要的的,比方将小文件组合成几个大文件,这样能够缩小从磁盘读取数据的工夫。然而应用这种办法须要在将数据写入 shard 之前彻底打乱数据,来防止学习收敛性好转。还须要抉择正当的 shard 大小(它应该足够大以避免磁盘问题并且足够小以无效地应用 datappipes 中的 Shuffler 打乱数据)。

最初本文的代码在这里,有趣味的能够自行测试比拟:

https://avoid.overfit.cn/post/d431289d4723430b882e189008aeb959

作者:Karina Ovchinnikova

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