Pandas 反对多种存储格局,在本文中将对不同类型存储格局下的 Pandas Dataframe 的读取速度、写入速度和大小的进行测试比照。
创立测试 Dataframe
首先创立一个蕴含不同类型数据的测试 Pandas Dataframe。
import pandas as pd
import random
import string
import numpy as np
# Config DF
df_length= 10**6
start_date= '2023-01-01'
all_string= list(string.ascii_letters + string.digits)
string_length= 10**1
min_number= 0
max_number= 10**3
# Create Columns
date_col= pd.date_range(start= start_date, periods= df_length, freq= 'H')
str_col= [''.join(np.random.choice(all_string, string_length)) for i in range(df_length)]
float_col= np.random.rand(df_length)
int_col= np.random.randint(min_number,max_number, size = df_length)
# Create DataFrame
df= pd.DataFrame({'date_col' : date_col,
'str_col' : str_col,
'float_col' : float_col,
'int_col' : int_col})
df.info()
df.head()
以不同的格局存储
接下来创立测试函数,以不同的格局进行读写。
import time
import os
def check_read_write_size(df, file_name, compression= None) :
format= file_name.split('.')[-1]
# Write
begin= time.time()
if file_name.endswith('.csv') : df.to_csv(file_name, index= False, compression= compression)
elif file_name.endswith('.parquet') : df.to_parquet(file_name, compression= compression)
elif file_name.endswith('.pickle') : df.to_pickle(file_name, compression= compression)
elif file_name.endswith('.orc') : df.to_orc(file_name)
elif file_name.endswith('.feather') : df.to_feather(file_name)
elif file_name.endswith('.h5') : df.to_hdf(file_name, key= 'df')
write_time= time.time() - begin
# Read
begin= time.time()
if file_name.endswith('.csv') : pd.read_csv(file_name, compression= compression)
elif file_name.endswith('.parquet') : pd.read_parquet(file_name)
elif file_name.endswith('.pickle') : pd.read_pickle(file_name, compression= compression)
elif file_name.endswith('.orc') : pd.read_orc(file_name)
elif file_name.endswith('.h5') : pd.read_hdf(file_name)
read_time= time.time() - begin
# File Size
file_size_mb = os.path.getsize(file_name) / (1024 * 1024)
return [format, compression, read_time, write_time, file_size_mb]
而后运行该函数并将后果存储在另一个 Pandas Dataframe 中。
test_case= [['df.csv','infer'],
['df.csv','gzip'],
['df.pickle','infer'],
['df.pickle','gzip'],
['df.parquet','snappy'],
['df.parquet','gzip'],
['df.orc','default'],
['df.feather','default'],
['df.h5','default'],
]
result= []
for i in test_case :
result.append(check_read_write_size(df, i[0], compression= i[1]))
result_df= pd.DataFrame(result, columns= ['format','compression','read_time','write_time','file_size'])
result_df
测试后果
上面的图表和表格是测试的后果。
咱们对测试的后果做一个简略的剖析
CSV
- 未压缩文件的大小最大
- 压缩后的尺寸很小,但不是最小的
- CSV 的读取速度和写入速度是最慢的
Pickle
- 体现得很均匀
- 但压缩写入速度是最慢的
Feather
最快的读写速度,文件的大小也是中等,十分的均匀
ORC
- 所有格局中最小的
- 读写速度十分快,简直是最快的
Parquet
总的来说,疾速并且十分小,然而并不是最快也不是最小的
总结
从后果来看,咱们应该应用 ORC 或 Feather,而不再应用 CSV ? 是吗?
“这取决于你的零碎。”
如果你正在做一些独自的我的项目,那么应用最快或最小的格局必定是有意义的。
但大多数时候,咱们必须与别人单干。所以,除了速度和大小,还有更多的因素。
未压缩的 CSV 可能很慢,而且最大,然而当须要将数据发送到另一个零碎时,它非常容易。
ORC 作为传统的大数据处理格局(来自 Hive)对于速度的和大小的优化是做的最好的,Parquet 比 ORC 更大、更慢,然而它却是在速度和大小中获得了最佳的均衡,并且反对他的生态也多,所以在须要解决大文件的时候能够优先选择 Parquet。
https://avoid.overfit.cn/post/387acc48c7dd42a49f7bec90cc6d09ae
作者:Chanon Krittapholchai