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1. Data
明天咱们将持续回顾咱们在上一次钻研的 Myc ChIPseq。
这包含用于 MEL 和 Ch12 细胞系的 Myc ChIPseq。
- 可在此处找到 MEL 细胞系中 Myc ChIPseq 的信息和文件
- 可在此处找到 Ch12 细胞系中 Myc ChIPseq 的信息和文件
我依照上一节中概述的解决步骤提供了来自 MACS2 的峰值调用。
MEL 和 Ch12 细胞系中 Myc 的峰值调用在上面
2. TF 联合和表观遗传状态
ChIPseq 的一个独特指标是表征全基因组转录因子联合位点或表观遗传状态。
转录因子联合位点和表观遗传事件的存在通常在其假设指标基因的背景下进一步剖析，以表征转录因子和表观遗传事件的性能和 / 或生物学作用。
随着 ENCODE 对转录因子联合位点或表观遗传状态的大规模映射的公布以及用于高通量测序的多重技术的呈现，反复 ChIPseq 试验已成为广泛做法，以便对已辨认的表观遗传事件具备更高的信念。
除了表观遗传事件的全基因组表征外，ChIPseq 已越来越多地用于辨认条件和 / 或细胞系之间表观遗传事件的变动。
咱们始终致力于解决和表征 Mel 细胞系中的 Myc ChIPseq 复制品。
在本次会议中，咱们将钻研如何在 Mel 细胞系中定义一组高置信度 / 可反复的 Myc 峰，以及如何辨认 Mel 和 Ch12 细胞系之间独特或常见的 Myc 联合事件。
本文由 mdnice 多平台公布
正文完
