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如果你只是在寻找经过时间的极其精确的度量，请使用 System.nanoTime()。System.currentTimeMillis()将为您提供自该纪元以来最精确的经过时间（以毫秒为单位），但 System.nanoTime()相对于任意点，您可以得到十亿分之一秒的精确时间。
从 Java 文档中：
public static long nanoTime()返回最精确的可用系统计时器的当前值（以纳秒为单位）。
此方法只能用于测量经过时间，并且与系统或挂钟时间的任何其他概念无关。返回的值表示自某个固定但任意的原始时间以来的纳秒（也许是将来的时间，因此值可能为负）。此方法提供纳秒精度，但不一定提供纳秒级的分辨率（即值更改的频率）。不能保证值更改的频率。由于数值溢出，跨越大约 292 年（2 的 63 次方纳秒）的连续呼叫中的差异将无法准确计算经过的时间。
总结一下：
1.System.nanoTime()的精确度更高一些，如今的硬件设备性能越来越好，如果要更精密计算执行某行代码或者某块代码所消耗的时间，该方法会测量得更精确。
2. 单独获取 System.nanoTime()没有什么意义，因为该值是随机的，无法表示当前的时间。如果要记录当前时间点，用 System.currentTimeMills()。
3.System.currentTimeMills()得到的值能够和 Date 类方便地转换，jdk 提供了多个接口来实现；但是 System.nanoTime()则不行。
4.System.currentTimeMills()的值是基于系统时间的，可以人为地进行修改；而 System.nanoTime()则不能，如果需要根据时间差来过滤某些频繁的操作，用 System.nanoTime()会比较合适。
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